土地证要以土地为主。而不是以房产证上登记的为准。因为是两个部门。像你这种情况就要查以前的地契或村里的宅基地登记，那里会有当时土地测量登记的底子， 包括测量人，记录人，长宽面积等信息。通常是：建筑面积以房产证上标明的建筑面积为准，占地面积以土地证上表明的占地面积为准。
这个恐怕要好好解决不然以后有问题应该以房产证为主现在的物权法好好看看
掏钱摆平
