1.发行成本不同，两者都有促进债券发行，降低债券利率的作用（附有认股权），分离交易可转换债券由于由债券和认股权证两部分构成，因此发行成本高。
2.分离交易可转债能够实现二次融资。一般可转债在转化为股票时，不需要再支付购股款，资金是初始购买债券的成本，只实现一次融资。分离交易可转债在行使认股权时，必须再缴纳认股款。实现了二次融资。
3.认股决定因素不同。一般可转债的认股数量，取决于可转债的面值和转股价，分离交易的可转债主要取决于认股权的规定，与债券价值无关。
4.存续期不一致。一般可转债认股权与债券存续期相同，但分离交易可转债的权证存续期不超过债券存续期，且自发行结束之日起不少于6个月。
5.对发行企业的负债股权结构影响不同，一般可转债执行认股后，减少发行企业负债，增加权益；分离交易可转债的债券部分要继续存在，直至偿还。认股权行使将增加权益。
6.条件不一致。分离交易的可转换债券不设重设和赎回条款。
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