由于药物对胚胎可能有一定的影响，因此对于女性患者一般建议停药半年后再怀孕，怀孕期间不要服药，孩子出生后如果服药，就不要哺乳。对于男性患者还没有很多的报道，但还是建议停药半年后再要小孩。
国外的一些研究显示，即使服药怀孕了，孕期服用了抗精神病药，其孩子出生的畸形比例与健康者出生的孩子的畸形比例相当，也就是说似乎抗精神病药并没有导致胎儿的畸形比例升高。
不过出于优生优育的考虑，还是建议停药怀孕，孕期不要服药，但这样往往会导致患者复发。临床上我们也见到过在服药期间怀孕了，孕期停了一段时间药，后来因疾病复发而服药，生下来的小孩没有什么畸形的情况，因此有的医生建议如果实在要用药，至少在怀孕头三个月不要用药，因为该时期是胎儿各系统发育的时期。
还要说明的就是，由于精神分裂症是一种多基因遗传疾病，其后代患精神分裂症的几率较健康者的后代高。另外出生时没有见到躯体的畸形，但不能保证孩子以后的心理发育一定正常。
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