通过官方途径开通微信小店，首先需要升级为服务号（注意：订阅号可以升级为服务号，但是服务号无法降级至订阅号，另外就我个人经验，订阅号升级到服务号后，认证就没了，需要重新认证，哭……不知道大家的是不是一样。）然后申请微信支付功能，需要2W保证金，这里需要确定您所经营的商品类目，微信团队会审核是否符合要求，另外会根据类目收取微信支付手续费费率，及确定结算周期等。通过微信支付功能的审核后，就可以开通微信小店了。
第三方安全性肯定没有微信这么安全，但是目前也没听说什么坑人的，小规模的微店是可以考虑的，毕竟官方微信小店门槛稍高。希望对你有用
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