沪昆铁路高速铁路线路走向均系初步方案。沪昆铁路客运专线杭州-长沙段的预可研工作由中铁四院、中铁一院编制,长沙-昆明段的预可研工作由中铁二院、中铁三院编制。根据中铁四院和中铁二院提供的线路走向初步方案,杭州-长沙段沿沪昆既有线路走向进入长沙,引入长沙南站与京广客运专线交汇。长沙-昆明段自长沙南站引出后向西抵达昆明。其中在浙江境内为上海铁路局管辖,江西境内为南昌铁路局管辖,湖南境内为广州铁路集团管辖,贵州境内为成都铁路局管辖,云南境内为昆明铁路局管辖。