学校三方协议违约处理方式如下:一、与签订三方的单位取得联系,委婉的表达想毁约的意愿,说明原因;建议采取邮件加电联的方式。电话联系的时候要注意说话方式,跟工作人员好好说话一般情况下不会出现情况;而邮件可以作为书面证据,你告知过原单位相关情况。