001云霄飞车杀人事件，新一和青梅竹马的毛利兰一起去多罗碧加游乐场玩，在乘坐云霄飞车时遭遇了杀人事件。成功解决案件后，新一跟踪两个神秘的黑衣男子，并目击了一名黑衣男子进行现金交易的现场，正当他全神贯注的时候，不料另一名黑衣男子突然从背后出现，将新一击倒，并灌下了组织新开发的毒药，新一感觉自己的骨头都要裂开了。。。
054电玩公司杀人事件，在参加满天堂游戏公司的新作发布会时，柯南意外听见黑衣组织成员之一的Tequila给VODKA打电话。不过Tequila旋即被误炸身亡。他本来的目的是想与电玩公司职员中岛交易获得全世界最有才华的程序设计师的名单，柯南迅速赶往中岛经常与之见面的酒吧时，那里却发生了爆炸，线索也随之灰飞烟灭。
128 黑暗组织10亿元抢劫事件，因为之前与漫画对应的“013奇怪的寻亲杀人事件”被改编，因此动画在这里添了一集，重新讲述了灰原的姐姐宫野明美被琴酒所杀的情节，为之后灰原出现作铺垫。通过GIN与宫野明美的对话我们得知，与仅仅是组织小卒的姐姐不同，宫野志保是组织里少数有头脑的人之一。
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件，组织代号SHERRY的宫野志保因姐姐被杀以停止APTX4869研究的方式表示抗议，结果被组织囚禁在瓦斯室。绝望的她服下了藏着的APTX4969想要自杀，没想到与新一一样没被毒死而身体缩小成儿童时期模样，得以挣脱了手铐从垃圾信道逃了出来。因为她之前已经从对新一家的调查中发现新一也变小了，所以新一成了她唯一的希望，最后疲惫的她倒在新一家门口，被隔壁的阿笠博士所救，并寄住博士家里，以一名转校生的身份成为了柯南的同班同学和少年侦探团成员。柯南因此得知了导致他变小的药的名字和大概信息，不过灰原却暗示此药原本的用途不是毒药。两人取回了错寄在广田教授家的存有药物资料的软盘正要查看时，不料电脑却被软盘里的暗夜男爵病毒感染，结果资料全毁。灰原虽然隐藏了起来，但是组织却没有放弃寻找叛徒的努力，柯南与灰原也就从此卷入了对组织侦查与反侦察的大戏中。不过灰原好像也没有透露更多组织的情报，此时的她对组织有着极度的恐惧感。
170-171黑暗中的死角，新出智明的父亲被其继母杀害，小五郎在柯南的协助下破案，乍看与主线毫无关系，之后的剧情却表明这里是青山历时两年的一个大伏笔，也是真正的新出智明在三方对决前唯一的一次出场。为保护无辜的女佣，警方修改的了案件的纪录，隐瞒了真实的作案手法，这一点只有真正的新出知道，日后也被朱蒂用来指证贝尔摩得假扮的新出智明。这时候新出只是帝丹高中篮球队的临时教练而不是校医，真新出本来是要去青森的医院工作而不是当校医，校医应该是VERMOUTH假扮成新出后为了调查当上的。从《361帝丹高中的学校怪谈（前篇）》中的柯南的话可以得到佐证。
另外值得一提的是在这一集里，因为新出智明，柯南吃醋了。
176-178 与黑暗组织的再会，柯南和灰原意外发现了GIN停在路边的车子，于是柯南在车上装上了发信器与窃听器想获得组织的情报，虽然得知了黑衣组织成员之一PISCO将在杯户饭店暗杀吞口议员的计划，但是窃听器被Gin发现并毁掉，而且他也通过遗留在车里的茶色头发联想到了SHERRY，并肯定她会在酒店现场出现。（一根茶色头发就联想到了灰原，更证明了灰原在组织里不是个一般人物。）柯南与灰原潜入宴会想阻止暗杀计划，不料非但没有来得及，而且灰原也不幸被PISCO识破身份并绑架囚禁在酒窖中。柯南一方面利用警察拖住嫌疑犯PISCO，一方面提醒灰原喝下白干成功恢复为SHERRY从壁炉逃出。不料GIN正在屋顶守株待兔，并开枪向SHERRY射击，在这千钧一发的时刻，柯南携变声器出现用麻醉针射中了GIN，SHERRY得以趁机从烟囱逃生，并恢复成了灰原。PISCO这时也来到酒窖想杀死灰原，却被柯南揭破了身份，结果PISCO被GIN灭口，死前也没来得及说出灰原＝SHERRY的秘密。GIN在与柯南的对决中被麻醉针所伤，也发现SHERRY有骑士保护。这一集我们的得到了很多信息，通过PISCO的话，我们的得知灰原研究的药不是单纯的毒药（“进展到了这个阶段”），而且她是继承了父母的研究。从后来GIN与VERMOUTH的对话中，我们比柯南更早得知了VERMOUTH就是当时的在场的美国超人气女星克里斯宾雅德，是她将紫色手帕分给PISCO想替他掩盖罪行。后来柯南怀疑当时PISCO有同伙也是基于此。VERMOUTH在事件后熄影并在日本隐居下来，不过从她的话中却看不出是接受了组织寻找灰原的任务，而是要“弄清楚一直担心的事”。（本人推测，这个“一直担心的事”应该与寻找新一有关。VERMOUTH在组织中虽然很受BOSS宠爱，但是长期混迹于冰冷的黑色中的生活厌倦，她的内心深处其实一直期待有美好的事物出现，有一颗划破黑暗的银色子弹解脱这阴暗的生活。在NY事件中VERMOUTH认识了的聪明勇敢的新一和阳光善良的兰，两人都给她留下了深刻印象。纯洁善良的兰使她重新燃起了希望，相信世间有真善美的存在，她也从此称兰为ANGLE。新一那相信一切都可以做到的自信眼神和聪慧练达的洞察力，更使她认定新一就是那个能终结黑暗组织的银色子弹。VERMOUTH十分珍视两人这份纯真的感觉，因此后来也一直不愿伤害两人，还多次设法保护，甚至柯南不离开就不对灰原下手。因此当她得知新一被组织用APTX4869下毒一直神秘失踪时，这个深受她器重的新一的下落就成了她“一直担心的事”，她也在日本隐居下来开始寻找新一，因此我认为是VERMOUTH先发现柯南的身份，然后才发现了灰原。这里她极有可能结合了自身变年轻的经历想到了新一变小的可能性。我推测她当年由于某种巧合使自身细胞活化重组而变的年轻，而那时宫野教授正因为怀有细胞自死然后活化的激进理论而被人称为疯狂科学家，黑暗组织的BOSS看到了宫野教授细胞理论对其计划的巨大价值而给宫野教授提供资金和资源供其研究，而VERMOUTH的变年轻更给了宫野教授的理论以现实的支持。在宫野夫妇死去后，他们的女儿志保继承了研究，但药物并未完成，此实验阶段的药物造成了实验对象的大量死亡，并且毒素无法从尸体里验出，从而使组织看到了APTX4869作为毒药的可能性，并且还可以顺带做人体实验，从而擅自将其作为杀人工具，此举还引起了灰原的不满。）VERMOUTH决定从小兰入手寻找新一，因此她盯上了新出智明的身份，决心杀死他并冒充他的身份当上帝丹高中的校医进行秘密侦查。VERMOUTH利用女星克里斯宾雅德的身份频繁出入新出的诊所，调查新出的生活习惯和人际关系，准备伺机取而代之。这时从美国尾随她而来的FBI朱蒂等人也洞察到了VERMOUTH的举动，便设下骗局，使真正的新出在她面前“事故死去”，其实将之秘密转移，并且开始监视新出的诊所。VERMOUTH看见新出一家在自己眼前出了事故，虽然有些疑惑，但还是假扮成新出出现。
188-193危命的复活，在这一系列中，VERMOUTH假扮的新出已经当上了帝丹高中和帝丹小学的校医。吃了灰原研制的解药后柯南短暂的变回了新一，并化妆成黑衣骑士与兰见面，却被化身为新出的VERMOUTH发现，而且被VERMOUTH偷偷拍下了照片，这一点可以从后来在朱蒂老师复制的照片那里得到佐证。VERMOUTH这时确认了新一没有死，但是由于当时灰原假扮的柯南也在场，因此还没猜到柯南=新一。有人说朱蒂这时也在场，照片有可能就是朱蒂拍的。朱蒂当时却是在场，从227格斗游戏的陷阱（后篇），她对兰夸奖舞会上的新一“SO COOL”来看，那天她一定见过新一。（这时朱蒂就已经潜进了学校这件事本身也证明了另一个事实，这时的新出就已经是VERMOUTH假扮的了。）可是除了那时有心调查新一的VERMOUTH会特别拍下照片外，都不知道新一是何方神圣的朱蒂怎么会特别拍下这个素未谋面的小子的照片呢？因此，照片还是VERMOUTH拍的。
226-227格斗游戏的陷阱，朱蒂与柯南相识，并注意到他借助园子破案，因此她发现了柯南不简单，在临走时COPY了VERMOUTH在照片上对柯南的称呼――COOL GUY。（这一举动也暗示着VERMOUTH已经在她的房间贴上了柯南的照片，并且已经知道了柯南的真实身份。我推测这时候并没有贴出宫野志保的照片。）事后朱蒂打电话给同伴时，给VERMOUTH取了“腐烂的苹果”的代号。但她表示她的监视对象“换了个身份，正在上学”在当时也给了我们她监视的就是柯南的误导。
230-231迷一样的乘客，刚开始时VERMOUTH与GIN的一段戏就表明了本集和主线有关，我们不但得到了VERMOUTH精于易容的信息，而且知道了她的目的是在日本寻找什么人，她的口头禅是A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN。少年侦探团和博士一行在公车上遇到一起去美术馆的朱蒂和新出，这时哀感到车上有组织的成员变得非常害怕（青山在漫画中告诉我们这个人就是VERMOUTH），后来公车被强盗劫持，虽然最后在众人的努力下强盗被抓，但是哀留在快爆炸的车上想一死了之，最后被柯南所救。朱蒂和赤井都是在监视VERMOUTH，好在在柯南的掩护下无论是朱蒂或是VERMOUTH都没有发现到哀。本集也是赤井秀一的第一次正式登场，不过他由于伪装感冒蒙着脸，灰原也因为柯南的保护没有露脸，所以两人都没有发现对方。当被制服的劫匪问朱蒂到底是谁时，她竟然也爆出了一句"A SECRER MAKES A WOMAN WOMAN"! 难道朱蒂老师的真实身份便是VERMOUTH？这一集灰原的感觉使我们找出了三个嫌疑人，朱蒂，赤井和新出，另外值得一提的是新出（VERMOUTH）在车上有维护柯南的举动。少年侦探团在车上说，感谢新出医生前几天帮他们做内科检查，但是灰原缺席。（新出医生可能通过这次身体检查，确认了柯南就是新一的事实。而且证明了假新出当时的目的是新一而不是到哀，否则哀的身份早就被她发现了，这一点可以从“361帝丹高中的学校怪谈”得到印证。）这一集开始VERMOUTH发现了自己的诊所受到了FBI的监视，也知道自己化妆的假新出身份已被FBI所知。（这时FBI已经掌握了VERMOUTH诊所里柯南，小兰和舞会上新一的照片，但是这时应该还没有贴出志保的。）因此她开始采取一系列误导和利用FBI的措施，首先她故意偷走了与毛利相关的所有案卷，在《269-270犯罪的纪念品》可以知道。
258-259来自芝加哥的男人，FBI头头登场。柯南等人认识了来自芝加哥的老男人“詹姆士 布莱克”，后来他被误认为是某名人而遭绑架，其实是将计就计，试试柯南的本事。柯南破解出熊猫车的暗号，救出了布莱克。布莱克最后竟然也称呼柯南为COOL GUY，说明了他和朱蒂是一伙的。赤井接布莱克走的时候说他被恋人甩了，所以剪短了头发。PS：这一集赤井的长发和点烟的样子甚至让人怀疑他和GIN是同一人！赤井驾车出现时被柯南和灰原瞥了一眼，灰原有奇怪的反应。柯南说布莱克先生不是坏人，只是对詹姆斯这个名字与莫利亚蒂教授相同有些在意（与詹姆斯 莫利亚蒂――福尔摩斯的宿敌同名），同时怀疑赤井。
266-268情人节的真相，京极真也带着黑色针织帽，被人看见，柯南以为是赤井，十分紧张。而小兰则说她可能认识这个带黑色针织帽的男人，引起了柯南的注意。
269-270犯罪的纪念品，破获录像带杀人事件的时候，从高木那里得知公车劫持案那天，毛利小五郎相关的案卷被偷，后又被送回来，暗示有人在调查他们，弄得柯南相当紧张。（后来据VERMOUTH说，偷窃毛利小五郎相关的所有案卷是让人不知道她其实是在找新出一个案子的记录，她找新出案件的资料是为了瞒柯南等人，虽然FBI已经知晓她的真实身份，但为了不在与小兰，柯南等历经了案件的人的接触中露出马脚，她还是要掌握案件的资料，但没想到是被改过的。再送回来是误导FBI让他们以为她留在日本的目的是与毛利侦探有关，从而让FBI监视毛利事务所来暴露身份。）故事的最后有赤井监视毛利侦探所的画面，表明了FBI果然将注意力转向毛利，但给人以赤井监视柯南的的误导。还有柯南本来想问兰关于带黑色针织帽的男人的事，但是最终没有说出口。
271-272急忙掩饰的忽略，柯南又一次在朱蒂面前破案。从朱蒂提醒兰有无人跟踪看，案卷被窃引起了FBI的警觉，朱蒂怀疑黑衣组织将对毛利不利。朱蒂在谈话中用鸵鸟一词来形容柯南小孩却有大人的智慧，并且提到了bureaus（事务所）代指FBI。（好像和后面出来的COMPANY代指CIA有点对应啊）本集结束时朱蒂说到了收割苹果的时候了，暗示FBI要对VERMOUTH采取行动了。VERMOUTH发邮件给GIN，提到了“久藏”雪利酒，并且向打了叉的宫野志保的照片发飞镖，旁边还有柯南和兰的照片。（本人推测此时VERMOUTH已经通过在《188-193危命的复活》系列中柯南暂时恢复新一这一事实联想到志保可能就在附近给柯南配置解药，并且决定将其找出来加以消灭，她借助FBI监视诊所的机会贴出了SHERRY的照片作为靶子，希望FBI帮她找出SHERRY。）
277-278英语教师VS西部名侦探，博士得知毛利小五郎相关的案卷被偷，后又被送回来，于是请来平次帮助柯南。两人分析偷盗案卷的人是想把某个人引出来的圈套，然后柯南又回顾了PISCO案件，怀疑克里斯是他的同伙，并进一步怀疑朱蒂=克里丝。虽然两人长相完全不同，但柯南知道克里斯精于化装。于是两人去朱蒂的公寓试探，并拜托博士在网上调查克里斯的资料。在双方接触过程中发生命案，案子虽然解决，但是对朱蒂的试探未果。这一集的重点就是最后在朱蒂的浴室的镜子后面出现的柯南，兰和舞会上的新一的照片，并且照片上的字迹和VERMOUTH的一模一样。按照后来的说法，这是朱蒂曾潜入新出医院，发现相关的照片后复制的。不过当时这些照片的出现，显然给了我们朱蒂=贝尔摩的的很大的误导，还有她最喜欢喝雪莉酒的提示更是使之雪上加霜。另外柯南最后说的除朱蒂外的另两个可疑人物应该是赤井和新出。
279-280迷宫的阴暗，博士应柯南的要求去克里斯的网站上查过信息，发现她就是美国已故大明星莎隆宾亚德的女儿。在母亲的葬礼上，她才第一次面对媒体。面对记者的追问，克里斯曾神秘的回答道：A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN。另外，日本的前超人气女明星也出现在了莎隆的葬礼中，从画面看正是有希子。（我认为正是基于这个证据，柯南推理出了莎龙和克里斯其实是一个人。）
284-285中华街雨中的似曾相识，
286-288工藤新一NY事件，承接前面兰回忆起的“带黑色针织帽的男子”，通过兰在发烧病倒时的回忆倒述了去纽约经历的黄金苹果事件。还交代了新一和兰和莎龙的初次见面，以及他们对银发杀人魔的救命之恩。最后提到真杀人魔其实是别人灭口的，后来得知假杀人魔正是VERMOUTH所扮，这次计划本来是将秀一引出并杀死，但是没有成功。
309-311与黑暗组织接触，案子的开头柯南和兰遇到了赤井秀一，在谈话中赤井提到了一个表面坚强、暗地流泪的女孩。（估计应该是指宫野明美，他的女朋友。）有人提到，对赤井说兰“经常”哭感到难以理解，其实这是因为赤井曾经监视过毛利侦探所，因此多次看见兰暗暗哭泣。另外借此，柯南也了解到了当年兰和赤井相遇的事情，获知了赤井FBI的身份，赤井的嫌疑大大降低。通过阅读板仓的日记得知，黑衣组织委托其开发一种危害人类的软件，但他并未最终完成。柯南诱骗VODKA改时间交易，试图冒充板仓与VODKA接头，从而想得到他的指纹和行踪的情报，不料即将成功之际，却由于GIN的忽然出现而功亏一篑，柯南还险些被发现，最后躲在储物柜里才侥幸得脱。最后柯南和哀离开的时候，在附近的赤井和哀好像对彼此都有所感觉。
335-336东都显影所的秘密，有希子回到日本，接侦探团去东都显影所看电影。在路上有希子和柯南发现他们正在被人跟踪，柯南认为跟踪者不是冲着他就是冲着灰原来的，并且很有可能就是黑衣组织的人。其实后来得知是赤井手下的人在监视柯南等人，结尾处赤井还拍下了少年侦探团的照片，还看着哀说太像了，说明了FBI已经中了VERMOUTH的圈套，帮助她找到了变小的SHERRY。但是当时却让人觉得赤井很可疑。
338-339 4辆保时捷，开头处柯南奇怪的骗博士说新出不在家，为什么不对博士老实说出对新出的怀疑？但后来不明情况的博士还是找来了新出给小哀看病，VERMOUTH假扮的新出就正式确认了哀就是SHERRY，并且在博士家装了窃听器，但是朱蒂同时也在场，所以那时我们将所有的怀疑都加到了朱蒂身上。结尾处VERMOUTH冷笑着用打火机烧掉了SHERRY的照片，并得意地自言自语道：“找到了……你准备好了吗？我来找你了！”VERMOUTH要准备采取行动了，真是山雨欲来风满楼啊。
340-341厕所隐藏的秘密，柯南、灰原和博士去了灰原的父亲宫野博士生前工作过的事物所，想从那里得到一些黑衣组织的资料以及灰原父母的行踪。结果他们在厕所中找到了宫野明美放在那里的灰原妈妈留给灰原的磁带。这一集透露了很多内容，开头处柯南说了句“如果我的推理正确的话，我们应该已经不在人世了”，证明他已经知道新出是克里斯假扮的，而且明白灰原和他的身份已经暴露，正是不知道她为什么还没有采取行动。灰原找到了明美藏起来的录音带，她的母亲的面目也浮出水面，“Hell Angle”由此而来。在她母亲留给她的18岁生日末尾的话语中应该提到了某件惊人的事情，但是青山并没有说明。结尾处，VERMOUTH边从飞机场出来边用手机通着电话，从谈话中我们得知，她找来了一个叫Calvados（苹果酒）的组织成员，似乎是为她下一步要采取的行动做的一个重要部署。另外值得一提的是，在灰原的梦中，青山已经给出了VERMOUTH究竟装扮成了何人的暗示，眼睛没问题的话，一定就可以发现了。
343-344便利店的阴谋，柯南发现工藤宅子有人来过的痕迹，而且不是小兰。朱蒂老师突然间辞去了帝丹高中英文教师的工作，说是想回美国了。（其实是要对VERMOUTH采取行动了）在告别派对上，小兰无意间在朱蒂的卫生间的镜子后面发现了朱蒂藏着的自己与柯南，灰原等人的照片，不禁疑云顿生。这也促使她下一集中偷偷躲在朱蒂后车厢里想调查她究竟想做什么。
345与黑衣组织直面对决满月之夜的二元推理,柯南收到了VERMOUTH寄来的邀请新一去参加化妆舞会的信件，称呼竟然是江户川柯南！柯南知道自己的身份已经暴露并且决定开始行动，他一方面邀请服部假扮新一去参加化妆舞会，另一方面用麻醉针麻醉灰原后假扮成她的样子准备独闯组织。来接他的不是VERMOUTH假扮的新出，而是朱蒂！原来FBI也有自己的计划，他们准备先VERMOUTH一步接走灰原，引诱VERMOUTH跟踪至码头，然后实施抓捕。（柯南这时应该不确定朱蒂和新出谁是VERMOUTH，而且他俩还有可能是一伙的，所以他带上了窃听器）朱蒂在车上表明了FBI的身份后，柯南告诉了她新出一案（170-171黑暗中的死角）的真相，要求她利用此来揭穿VERMOUTH，以取得自己的信任。朱蒂揭穿了VERMOUTH同时是克里斯宾雅德和莎龙宾雅德，但在她招呼同伴要抓捕VERMOUTH时，不料却被埋伏的Calvados击伤。原来VERMOUTH棋高一着，她早就知道了FBI的抓捕计划，提前化妆成朱蒂来到码头，命令埋伏的FBI探员撤退了。而且VERMOUTH对FBI监视新出诊所也早已知晓，偷走案卷是为了引诱FBI暴露身份，贴出宫野志保的照片是利用FBI寻找目标。正当朱蒂形势危及时，另一边化妆的服部解决了舞会上的案子扯下了伪装，柯南也撕下面具用麻醉针控制住了VERMOUTH，柯南的筹划终于笑到了最后。但是这时风云突变，担心柯南安危的灰原利用备用的追踪眼镜忽然找来，反而破坏了柯南的大好计划，VERMOUTH趁机用麻醉针射中了柯南，并把手枪对准了灰原！就在这形势失控的时候，小兰忽然从朱蒂车子的后备箱跳出保护了灰原，赤井也及时出现迫使VERMOUTH不得不以柯南为人质逃离了码头。正当VERMOUTH向BOSS发邮件报告时，忽然发现柯南身上有发信器，原来柯南留了一手，他早料到VERMOUTH找到灰原后一定会向BOSS报告。VERMOUTH不得不承认放弃SHERRY，为了避免BOSS的邮件地址和身份泄露，VERMOUTH不得不使用了催眠瓦斯，并且朝自己开了一枪以保持清醒，毁掉发信器后狼狈逃离了现场。
425 Black impact！被组织的魔掌触碰的瞬间，通过忘记取回的窃听器，柯南却发现了惊天的大秘密！原来电视台主持人水无怜奈也是黑衣组织的成员，柯南窃听到了她和GIN等人的暗杀计划，并成功阻止。不料琴酒发现水无鞋底的窃听器，小五郎反而受到他们怀疑，危在旦夕。好在秀一及时出现，击伤了GIN，将装窃听器的勾当揽到了FBI身上。VERMOUTH也又再次保护了毛利等人。代号KIR的水无怜奈在行动中受伤昏迷，被FBI送入杯户中央医院控制了起来。另外这一集中柯南得知了布莱克也是FBI的人。
429-430无法回到从前的两个人，小兰的倒霉同学本堂英佑出场，眼睛长的和水无很像，好像注意到了柯南通过毛利破案，这让柯南感觉很不安，对本堂的身份产生了怀疑。
462黑衣组织的影子 年幼的目击者，一个孩子目击某歌星被人从桥上扔下，本堂用和水无一样的摸脉搏测谎术，引起了柯南的怀疑。
463.黑衣组织的影子 奇怪的照明，本堂数次想让毛利等人想起水无的事情来获取信息，但是都被柯南看出并把话题岔开。
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬，本堂故意引诱毛利注意到一个小孩家发生的奇怪事件，这个小孩正是目击水无怜奈受伤的小孩，他说他的母亲生前曾经和奇怪的外国女人对话，打听水无怜奈的去向。
465.黑衣组织的影子 珍珠流星，在那个小孩就要说出摔下摩托车的就是主持人水无怜奈时，柯南及时用假面超人将话题岔了开去。柯南通过外国女人对孩子的回答"A SECRER MAKES A WOMAN WOMAN"推测出这个女人就是VERMOUTH。另外本集GIN所说的水无取得BOSS信任的事件也表明她与一个叫本堂的卧底的死有很大关系。
484-485黑色照片的去向，服部调查水无未果，但意外发现本堂及其父亲在大阪生活的情况，因为瑛佑小时候曾经和父亲一起去大阪的烧烤屋吃烧烤，其父和店长很谈得来。然而店长已经去世，所以柯南、阿笠博士和灰原决定造访住在东京的店长的孙子家，想从他那里得到些本堂及其父亲的情报。不料在这个模型爱好者西郡家里遭遇了盗窃案件，成功解决后柯南他们终于看到了瑛佑无意间照的照片，照片上看到了瑛佑的父亲，并了解到瑛佑的父亲常和黑西装的外国人打交道，并在Company（＝CIA）工作，曾打入过黑衣组织。
491-504 红与黑的碰撞系列
剧场版
03 世纪末的魔术师☆(哀、KID都出场)
04 瞳孔中的暗杀者☆（哀）
08 银翼的魔术师☆（KID）
OVA
OVA5 目标是小五郎！！少年侦探团的秘密调查（哀、少年侦探队）
『2009年』
521 杀人犯 工藤新一
522 新一的真实身份和兰的眼泪
523 真正想问的事
524 憎恶是青色的火花（前篇）
525憎恶是青色的火花（后篇)
主线剧情必看：
001云霄飞车杀人事件（组织）
043江户川柯南诱拐事件(父母知道变小)
048~049外交官杀人事件(平次登场，第一次恢复)
054电玩公司杀人事件（组织）
057，058福尔摩斯迷杀人事件(平次知道身份)
128黑衣组织10亿元抢劫事件
129来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件（组织）
170，171暗阁中的死角（新出登场）
176，177，178与黑暗组织的再会（组织）
188－－193危命的复活（新一，兰）
226，227格斗游戏的陷阱（朱蒂登场）
230，231谜一样的乘客（赤井登场）
258，259来自芝加哥的男子（詹姆斯登场）
269，270犯罪的纪念品（有提到警察局关于毛利的案卷被偷一事）
271，272紧急隐藏的省略（朱蒂）
277，278英语教师VS关西侦探（朱蒂）
284~285中华街雨中的似曾相识
286，287，288工藤新一NY事件（不用多说了吧）
307，308无声的证据（组织相关，下一集的引子）
309，310，311与黑色组织的接触（组织）
335，336东都显影所的秘密（有神秘人）
338，339 4辆保时捷（朱蒂和贝尔摩德假扮的新出发现哀）
340，341隐藏在厕所里的秘密（更多关于哀父母的消息，找到明美藏起来的录音带）
343，344便利店的陷阱（最后一段是小兰发现朱蒂藏的照片，怀疑朱蒂）
345与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案（不多说了）
346，347寻找P股上的印记（上集案件的扫尾，关于哀拒绝证人保护计划的事）
385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间(水无怜奈登场，小五郎受到怀疑，若不是秀一就挂掉了)
429--430无法回到从前的两个人(本堂)
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
507 卡拉OK房间的死角（前篇）
508 卡拉OK房间的死角（后篇）
还有些集案件本身没什么，其间就一两句话和组织的事有点关系或者哀的话暗藏玄机
130--131竞技场无差别胁迫事件(故事内容和主线情节无关，但灰原讲的一句话曾让广大柯南迷浮想联翩：“工藤君，也许你自己不知道，其实半个世纪前你就在组织的计划中了”。这究竟是怎么一回事？半个世纪前优作大概都没出生呢！看来只有等青山来解释了。)
222--224招致死亡的人鱼传说（人鱼小岛签名册有宫野志保的名字）
242元太的灾难（好像提到GIN是左撇子)
246--247网中的谜事件（哀和兰握手）
253－-254本厅刑事恋爱物语(本身案件无意义，不表。有两个值得注意的地方是，一是小兰在饭店里看到赤井秀一居然有似曾相识的感觉，二是柯南和新出合力扮演了高木警官，一个出身材和动作，一个出配音。望月以为，有可能就是从这集开始，柯南对新出的身份产生了怀疑。因为他注意到了新出超强的模仿能力。)
279--280迷宫的阴暗（这集哀说了很多话;主线情节只被带到了一点。博士应柯南的要求去克里斯的网站上查过信息。发现她就是美国已故大明星莎隆.宾亚德的女儿。在母亲的葬礼上，面对记者的追问，克里斯曾神秘的回答道：A SECRET MAKES A WOMAN WOMAN.另外，有希子也出现在了莎隆的葬礼中，但是她的帽檐压的很低，所以美国的网站上显示当时并没有人认出有希子的身份，只是谣传说日本的前人气女明星也出席了葬礼。）
289--290迷惘森林中的光彦（上下集）（有提到哀对组织气味已经不敏感了。和沼渊已一郎是组织一员的事。）
312--313染上夕阳的布偶（哀说了关于夕阳的话）
329-－330金钱买不到的友情(本集中提到了灰原的父亲：宫野厚司。原来他是化学领域非常有名的科学家，被称为“被科学界放逐的疯狂科学家”，待人和气有礼，并且是阿笠博士的旧识。)
精彩剧集：
首推剧场版1-10，11集无聊，12集很期待。
第一部： 1997 引爆摩天楼 (时计じかけの摩天楼/A Clockwork Skyscraper) 1997/04/23
第二部： 1998 第十四个目标 (14番目の标的/The Fourteenth Target) 1998/04/15
第三部： 1999 世纪末的魔术师 (世纪末の魔术师/Last Wizard of the Century) 1999/04/14
第四部： 2000 瞳孔中的暗杀者 (曈の中の暗杀者/Captured In Her Eyes) 2000/04/12
第五部： 2001 通往天国的倒计时(天国へのカウントダウン/Count Down To Heaven) 2001/04/11
第六部： 2002 贝克街的亡灵 (ベイカー街の亡霊/The Phantom of Baker Street) 2002/04/17
第七部： 2003 迷宫的十字路 (迷宫の十字路/Crossroad in the Ancient Capital) 2003/04/19
第八部： 2004 银翼的魔术师 (银翼の奇术师）/Magician of the Silver Sky) 2004/04/17
第九部： 2005 水平线上的阴谋 (水平线上の阴谋/Strategy above the Depths) 2005/04/09
第十部： 2006 侦探们的镇魂歌 (探侦たちの镇魂歌/The Private Eye's Requiem) 2006/04/15
第十一部：2007 绀碧之馆 (绀碧の棺/Jolly Roger in the Deep Azure) 2007/04/21
第十二部：2008 战栗的乐谱 (戦栗の楽谱/Full score of Fear) 2008/04/19日本上演
再推特别编，几乎个个精彩：
特别篇01-011 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件 1小时特别篇
特别篇02-052 雾天狗传说杀人事件 1小时特别篇
特别篇03-076 柯南vs怪盗基德 1小时特别篇
特别篇04-096 走投无路的名侦探！连续两大杀人事件 2小时特别篇
特别篇05-118 浪花连续杀人事件 1小时特别篇
特别篇06-129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 2小时特别篇
特别篇07-162 空中飞行的密室 工藤新一最初的事件 1小时特别篇
特别篇08-174 20年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件 2小时特别篇
特别篇09-184 诅咒的假面在冷笑 1小时特别篇
特别篇10-208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒 1小时特别篇
特别篇11-219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德 2小时特别篇
特别篇12-263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁之城 2小时特别篇
特别篇13-304 震动警视厅 1200万名人质 2小时特别篇（隆重推荐，同属恋爱物语系列）
特别篇14-342 豪斯登堡的新娘 1小时特别篇
特别篇15-345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理 2.5小时特别篇
特别篇16-356 怪盗基德的惊异空中步行 1小时特别篇
特别篇17-383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔 2小时特别篇
特别篇18-425 黑暗冲击！被组织的魔爪触碰的瞬间 2.5小时特别篇
特别篇19-449 本厅的刑警恋爱物语 虚假的婚礼 1小时特别篇
特别篇20-452 金比罗剧院的怪人 1小时特别篇
特别篇21-479 和服部平次在一起的3天 2小时特别篇
特别篇22-487 本厅刑事恋物语8 左手的无名指 1小时特别篇
特别篇23-488 电视台的恶魔 1小时特别篇
特别篇24-489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官 1小时特别篇
特别篇25-490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决 1小时特别篇
三推KIDD：
076《柯南对怪盗基德》
132《魔术爱好者杀人事件（事件篇）》
133《魔术爱好者杀人事件（疑惑篇）》
134《魔术爱好者杀人事件（解决篇)）》
219《名侦探大集合 工藤新一VS怪盗基德》
356《怪盗基德之奇异的空中步行》
394《奇异屋宇的大冒险（封印篇）》
395《奇异屋宇的大冒险（机关篇）》
396《奇异屋宇的大冒险（解决篇) 》
469《基德与四幅名画（前篇) 》
470《基德与四幅名画（后篇) 》
473《工藤新一少年时的冒险》
剧场版：
三《世纪末的魔术师》
八《银翼的魔术师》
十《侦探们的安魂曲》
四推恋爱物语系列：
146-147本厅刑事的恋爱物语
柯南他们去录口供之类的，正式与佐藤见面，高木猜测佐藤到底喜欢谁的时候很有意思。
156-157本厅刑事恋爱物语2
佐藤在抓捕犯人时，不慎与犯人一起锁在了马上要爆破的废楼厕所里。当了解到犯人可能有冤情后，佐藤让高木在有限的时间内找出真凶，并且回来救她们两人。佐藤得救后的情节非常好笑。
205-206本厅刑事的恋爱物语3
很感人的一话。佐藤的父亲在她很小时就因为抓犯人殉职了，而犯人却没有抓到。在父亲祭日那天，听到佐藤的故事后，明白“愁思郎事件”真相的高木警官却被犯人袭击，被关在了着火的小屋中。尽管身处险境，却仍然不愿弄坏佐藤父亲遗物的高木本话中的表现非常强眼。
253-254本厅刑事恋爱物语4
佐藤相亲了，对方居然是那个白鸟！两人居然还打赌如果高木不能在日落之前赶来就订婚！！而且有订婚吻哦~最后虽然高木抓到了犯人，却好像来不及赶去给佐藤解围了。到底赌约的结果如何呢？
358-359本厅刑事的恋爱物语5
最好先看一下前面的那几集再来看这集。了解一下松田后，会觉得这集又好笑又感人。高木与佐藤的第一次约会，警事厅大部分男警察也都同时请假，由白鸟指挥坚决要扰乱这次约会。
390-391本厅刑事恋爱物语6
听说警部要派叫高木的警官去鸟取县破案，最快也得3年才能回来，高木要怎么办呢？
431-432本厅刑事的恋爱物语7
不约而同，两人都去参加同一个联谊，当然都成了大醋坛。联谊未结束却遇到了小孩子的绑架案。
449 本厅刑事恋爱物语7---虚假的婚礼
487 本厅刑事恋爱物语8---左手的无名指
五推超级感人剧情：
011 钢琴奏鸣曲“月光”杀人事件（火光映红的夜空，今夜，月影岛上还能看见月亮吗？“月光”奏鸣曲行云流水般的旋律，听起来却只剩下夜一般沉寂的悲伤，那被火焰吞噬的苦涩的微笑，遗憾伤感的不仅仅是柯南一人。如此纯洁的音乐，不应被罪恶玷污。父亲希望的，应该也是孩子能幸福快乐的活下去，而不是在复仇的毒蛇的驱使下，走上那条不归路。）
018 六月新娘杀人事件 （因为柯南的一句“3年后”造成了非议）
027 小五郎同学会杀人事件（前篇）
028 小五郎同学会杀人事件（后篇） （这两集是柯南和小兰一起洗澡，还让我们看到毛利也不糊涂）
037 仙人掌花杀人事件
042 卡拉OK歌厅杀人事件 （悲惨的结局，两个相互错过的人，一个不愿意承认事实的青年，跟一个隐藏面貌的女子，就这样错过了幸福，写下了悲剧。在她悲伤的哭声和眼泪中，只有那张照片，还在悲伤的笑着。离第一次看这个案件已过去很多年了，可尾声的这段话却留在记忆里久久不能忘怀。可能因为这是柯南第一处让我有冲动想流泪的地方，连空气里仿佛都浸渗着那种黯然神伤的情绪。应了那句老话：明明相爱，为什么要互相伤害！和朋友谈起这个案件的时候，她淡淡一句：“死了也是活该。”无语。活该？也许吧，如果他们能坦诚相见，如果没有那么多面具下的隐藏，如果．．．．．．可是这个世界真的是没有这么多的如果的，所以我们只有不断前行，带着伤带着泪也要不断前行，不能回头！）
077-078 名门连续惨死事件（没错，这就是我们的大侦探说出“我们侦探把犯人逼到尽头，如果最后就让他们自我了结的话，那和杀人犯有什么不同”的名言的那一集，而让他将这个信念贯彻实施的正是日向幸这个女子。坦白说日向幸与长门秀臣之间的爱情悲剧指数绝不输给上面那对，但可能是新平这对黄金搭档的演出太精彩了，那段名言又太如雷贯耳了，案件本身反而没什么人记得了！
“这是我跟他之间的命运，我们从好久以前就已经被火的牵绊绑在一起了．．．．．．”
“因为我不希望让他这样泡在那么冰冷的池水里面．．．．．．”
“不能原谅．．．．．．不过我自己．．．．．．却已经无可救药的爱上他了！”）
095 小五郎约会杀人事件 （再来见识一下毛利吧~~~）
100 初恋情人回忆事件（前篇）
101 初恋情人回忆事件（后篇） （这两集总体给人的感觉是蛮悲惨的）
116 推理小说家失踪事件（前篇）
117 推理小说家失踪事件（后篇） （其实也是挺悲哀的）
136 蓝色古堡探索事件（前篇）
137 蓝色古堡探索事件（后篇）（超级恐怖，为了毫不存在的“宝藏”，把自己整成老太婆）
153 园子的夏日海滩冒险物语（前篇）
154 园子的夏日海滩冒险物语（后篇） （园子的“黑马王子”终于出现了。兰在救园子，用脚踢破车窗的镜头真是百看不厌）
166 鸟取蜘蛛公馆的怪事（事件篇）
167 鸟取蜘蛛公馆的怪事（疑惑篇）
168 鸟取蜘蛛公馆的怪事（解决篇）（“‘为什么自己不是日本人？为什么她不是美国人？’就像是故障的扯线公仔一样，重复．．．．．．又重复着”
因为语言不通造成的误会，竟致一对相互爱恋的男女就此天人永别，进而演绎出一幕惨剧。沉浸在新平推理秀及蜘蛛公馆诡秘气氛中的观众们，还没忘记这一对错过得比窦娥还冤的情侣吧。虽然不喜欢这家伙，因为能想出那种杀人手法及死状的人铁定心理不太正常，而且居然敢对偶们家和叶小妹痛下杀手（虽然未遂），想被平和迷们丢去喂蜘蛛么！不过看在人家痛失爱侣的份上，蛮可怜的，也算你一个吧。）
201 第10位乘客（前篇）
202 第10位乘客（后篇） （经典）
203 黑天使之翼（前篇）
204 黑天使之翼（后篇） （还是经典）
210 五彩传说的水中豪宅（前篇）
211 五彩传说的水中豪宅（后篇） （KID的出现）
212 蘑菇、熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山和侦探队（后篇） （光也对哀产生了情感）
217 目暮尘封的秘密（前篇）
218 目暮尘封的秘密（前篇） （目暮为什么老是戴帽子，秘密在这里）
220 满口谎言的委托人（前篇）
221 满口谎言的委托人（后篇） （平次的妈妈出现）
222 人鱼又再度悲泣（事件篇）
223 人鱼又再度悲泣（推理篇）
224 人鱼又再度悲泣（解决篇） （超级经典！平次对和叶迷迷糊糊的话语，在表白吗）
238 大阪3K事件（上集）
239 大阪3K事件（下集）（“不行，雷，无论你遇到多么不幸的事情，都不是你吸毒和杀人的借口，只能得到可耻的红牌。”当柯南说出这句话的时候，可以想见其内心的痛苦。之于偶像，有时并不只是一个喜欢的对象，他可能更像是一个完美的憧憬。这也是为什么神圣的光环一旦消逝，心里会有失望、苦痛、愤怒的原因，像心爱的瓷娃娃一瞬间被无情的打碎了，一个令人愉快的梦醒了。法理与人情，公私分明谁都会说，真要一丝不苟的执行其实很难很难，情非得以，情难以堪呀！雷犯的罪，其实没什么可原谅的，但看在他是新一的偶像，把他也列出来，算是代新一徇一次私吧。）
266 情人节的真相（事件篇）
267 情人节的真相（推理篇）
268 情人节的真相（解决篇） （为了哥哥报仇，杀了自己的爱人）
291 孤岛的公主与龙宫城（事件篇）
292 孤岛的公主与龙宫城（追求篇）
293 孤岛的公主与龙宫城（解决篇） （平次、和叶、兰、柯南）
323 服部平次走投无路！（前篇）
324 服部平次走投无路！（后篇） （受伤了）
376 限时15时
381 谁的推理秀（前篇）
382 谁的推理秀（后篇）
400 心存疑惑的兰（兰怀疑柯南）
406 柯南和平次的推理魔术(装置篇)
407 柯南和平次的推理魔术(公馆篇)
408 柯南和平次的推理魔术(解决篇)
421 银杏色的初恋（前篇）
422 银杏色的初恋（后篇） (关于阿笠博士的初恋,很感人)
437 上户彩与新一 4年前的约定 (有新一在的就是经典)
最后说说柯哀（由于我是站在新兰一边，所以总结的不全）：
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件（哀趴在柯南身上哭得声嘶力竭，这大概是哀最本色的时候吧）
超人气偶像灰原哀的登场（灰原是望月看了N年漫画以来喜欢上的第一位女性角色，对其喜欢程度简直让望月怀疑自己是否有了恋童癖）。这个酷劲十足的MM智商超群，推理能力仅比柯南稍逊一筹，并且有着谜一般的过去。与小兰不同的是，小兰过于完美，而灰原正是有着所谓的“人格缺陷”，反而让人觉得比小兰更耐看，更有味道。
评论：灰原登场的影响是深远的。不仅是柯南的内容由简单的推理秀开始向主线故事情节发展的标志，也是柯南开始反弹的开始。之前由于推理内容开始重复并且已经到了一定的集数，使得观众开始逐渐对柯南失去了兴趣，收视率开始逐年降低。然而自从灰原出场以后，收视率爆增至排行榜首位并且高居不下，一举奠定了柯南在日本第一动漫的地位，而我们广大的柯南迷从此也开始分裂成新兰恋和新哀恋两大阵营。一切的一切，都说明灰原哀这个角色的魅力有多大！
经典画面：1/灰原开枪射击，酷到极点！！
2/故事结尾，灰原带着一丝让人琢磨不透的微笑对柯南说：看来我们要相处很长一段日子了，江户川君。柯南则是警惕的瞪视灰原。伴奏音乐响起，两人相对而立，背景是Gin和Vodka的巨大身影。顿时整个画面给人一种柯南和灰原双雄对决的气氛，感觉特别好！
136~137 青色古城探索事件
感觉不错的一集，
柯南和博士失踪后，灰原带领着侦探团寻找他们
感觉哀好强哦
176~178 与黑衣组织的再会
柯哀的重头大戏哦！
情节蛮紧张的……
中间灰原喝了点白干，变回志保，不过被Gin打了N枪，好可怜
灰原变大前被关在一个酒窖里，So……
变大后，柯南问她，你穿衣服没？
哀骂他素色狼，哈哈！！
212 蘑菇、熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山和侦探队（后篇） （光也对哀产生了情感）
230－231迷一样的乘客 （车中炸弹要爆炸时，灰原仍然没有逃走，她想就此结束自己的生命。此时柯南再次出现，用灭火器砸碎了车窗，并且在炸弹爆炸前的一秒中抱起灰原跳出窗外，被炸弹的冲击波推出老远。绝对有好莱坞大片的影子。）
279~280 迷宫的阴暗
哀饭必看的一话哦
哀的著名的话
哀：你不是说过的吗？
柯南：……
哀：别逃 你不是说不要逃离自己的命运吗
柯南：……
哀：你会保护我的吧
柯南：呃…… 嗯
哀：我可不是你想的那种只会说保护我的富家小姐
340~341 厕所隐藏的秘密
博士找到哀的父母的线索
带着柯南和灰原去了解详情
却意外发现了她的姐姐明美藏在卫生间里的，小哀的母亲留给她的磁带
不错的一集哦，也是主线之一
还有喜欢的对白
柯南：这家伙 假哭你很拿手，装睡可就很差劲了你这家伙 干什么啊？明明特地来给你煮粥 还摆架子吗？
哀：没什么，又不是我让她来的
柯南：不过我也不是不知道你不是很习惯小兰这种喜欢照顾人的类型。她好容易辛辛苦苦煮的粥，在冷掉之前赶快给我吃掉。
哀（心里想）：你还是不知道 什么都不知道。不过我也并不希望你知道。
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案
主线剧集哦，部分谜团被解开
中间的人物……有点晕
扮过来扮过去的，有希子化妆技术虽高，这班人看得迷糊了
值得一提的，有新一的出场（随是某人扮的，看在比较像的份上就原谅他了）
不多说了，自己体味吧……
401~402 宝石抢匪现行犯
看过400的人都会意识到吧
柯南跟小兰说的喜欢的女生，是灰原哦
虽然是不得已骗她 但是，感觉好好
关键时候，柯南同学还是需要灰原作挡箭牌啊
还有案件…… 小哀的话真是一语中的
柯南那招，也蛮帅的
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
不用我多说了吧
001 云霄飞车杀人事件(这个是初登场，所以也很值得纪念。其中某新对和兰接吻的遐想。。- - 这个是最早的新兰戏了）
010 足球选手恐吓事件（某新最后那句“我也会心疼”的话真是够煽情呀。俩孩子的小脸都红了。这个虽然是破案，其实整个都是围绕新兰。兰吃醋了，后果很严重。于是某新只能拿这种烂情话来补救了。。orz）
100-101 初恋情人回忆事件（既然是这个名字。自然是很有噱头的。其实是当年有女生像新一表白，但他说自己已经有喜欢的人了“她是我心中的女神”。小正太果然有爱。）
162 飞天密室工藤新一最初的事件（多么有爱啊。。新一和兰在飞机上。相当可爱呀。其实有很多有趣又甜蜜的桥段。觉得值得一看呐）
188-193 危命的复活（这个是一系列的，整个剧情都很精彩，如果要看新兰的，可以从191的黑衣骑士开始看。嗯。这个有非常经典的新兰接吻的戏。后面新一还邀请兰去当年他父母订婚的酒店吃饭。）
286-288 工藤新一NY事件（这个应该是162集的后续。整个故事的场景非常有feel.依然有有爱的桥段。然后还有新一扑救兰的情节。总之这个就是新兰剧情）
343-344 便利店中的阴谋（这个是兰的推理。其中一直贯穿着新一的支持。电话中的那些话也是73一贯用的手法。）
472-473 新一少年时的冒险（这个是小时候的故事。纯新兰。萌）
我来推荐几部，绝对不容错过的哦！ 首先说剧场版，目前出了12部,下面我列出我非常喜欢的，百看不厌：
1.引爆摩天楼
3.世纪末的魔术师
4.瞳孔中的暗杀者
5.通往天国的倒计时
6.贝克街的亡灵
8.银翼的魔术师
再说TV版好看的有:
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
309 与黑衣组织接触（交涉篇）
310 与黑衣组织接触（追踪篇）
311 与黑衣组织接触（决死篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
上面说的都是主线,很好看。
再说特别篇，也有几个非常好看的：
076 柯南对怪盗基德
356 怪盗基德之奇异的空中步行 1小时特别篇
直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件
425 黑暗冲击！ 被组织的魔爪触碰的瞬间★
515 特别篇基德的瞬间移动
震动的警视厅！1200万人质
还有OVA 也有几个很好看的：
怪盗基德VS柯南VS YAIBA宝刀争夺大战
基德与水晶之母
就这么多吧，也够你看的了，都是我精挑细选的哦 ，很好看的。
以下的几个让我流过泪：
剧场版的1.引爆摩天楼
3.世纪末的魔术师
4.瞳孔中的暗杀者
5.通往天国的倒计时
震动的警视厅！1200万人质
以上我一个字一个字打的，谁COPY我咬谁。
188 危命的复活 洞窟内的侦探团
189 危命的复活 负伤之下的名侦探
190 危命的复活 第三个选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
286 工藤新一纽约事件(事件篇)
287 工藤新一纽约事件(推理篇)
288 工藤新一纽约事件(解决篇)
400 持有疑惑的小兰
11 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件 1小时
52 雾天狗传说杀人事件 1小时
76 柯南VS怪盗基德 1小时
96 走投无路的名侦探！连续两大杀人事件 2小时
118 浪花连续杀人事件 1小时
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件 2小时
162 飞天密室 工藤新一最初的事件 1小时
174 20年的杀意 圣佛尼号连续杀人事件 2小时
184 诅咒的假面的冷笑 1小时
208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒 1小时
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德 2小时
263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁之城 2小时
304 震动警视厅 1200万名人质 2小时
342 豪斯登堡的新娘 1小时
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重谜案 2.5小时
356 怪盗基德的惊异空中步行 1小时
383 甲子园的奇迹！绝不能输给看不见的恶魔 2小时
425 黑暗冲击！组织魔爪伸来的瞬间 2.5小时
449 本厅刑事恋爱物语 虚假的婚礼 1小时
452 金比罗剧院的怪人 1小时
479 和服部平次在一起的3天 2小时
487 本厅刑事恋物语8 左手的无名指 1小时
488 电视台的恶魔 1小时
489 法庭的对决Ⅲ 目击者是检察官 1小时
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决 1小时
第一部： 1997 引爆摩天楼 (时计じかけの摩天楼/The Timed-Bomb Skyscraper) 1997/04/23
第二部： 1998 第十四个目标 (14番目の标的/The Fourteenth Target) 1998/04/15
第三部： 1999 世纪末的魔术师 (世纪末の魔术师/The Last Wizard Of The Century) 1999/04/14
第四部： 2000 瞳孔中的暗杀者 (曈の中の暗杀者/Captured In Her Eyes) 2000/04/12
第五部： 2001 通往天国的倒计时(天国へのカウントダウン/Count Down to Heaven) 2001/04/11
第六部： 2002 贝克街的亡灵 (ベイカー街の亡霊/The Phantom of Baker Street) 2002/04/17
第七部： 2003 迷宫的十字路口 (迷宫の十字路/Crossroad in the Ancient Capital) 2003/04/19
第八部： 2004 银翼的魔术师 (银翼の奇术师）/Magician of the Silver Sky) 2004/04/17
第九部： 2005 水平线上的阴谋 (水平线上の阴谋/Strategy above the depths) 2005/04/09
第十部： 2006 侦探们的镇魂歌 (探侦たちの镇魂歌/The Private Eye's Requiem) 2006/04/15
第十一部：2007 深蓝色的海盗旗 (绀碧の棺/Jolly Roger in the Deep Azure) 2007/04/21
第十二部：2008 战栗的乐谱 (戦栗の楽谱/Full Score of Fear)
剧场版
03 世纪末的魔术师☆(哀、KID都出场)
04 瞳孔中的暗杀者☆（哀）
08 银翼的魔术师☆（KID）
OVA
OVA5 目标是小五郎！！少年侦探团的秘密调查（哀、少年侦探队）
TV版
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件（哀的出场）
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
^^^^230 谜一样的乘客（前篇）（柯哀经典啊，柯南救了小哀！）
231 谜一样的乘客（后篇）
^^^^335 东都显影所的秘密（前篇）（新一妈妈让柯南好好保护小哀）
336 东都显影所的秘密（后篇）
^^^^345 与黑暗组织直面对决!满月之夜的二元神秘事件（柯哀经典：柯南小哀感人版）
423 侦探团与青虫4兄弟（少年侦探团）
515 怪盗基德的瞬间移动魔术（特别篇）（怪盗基德）
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