药监局和卫生局是不同的职能部门。药监局是国务院综合监督管理药品、医疗器械、化妆品、保健食品和餐饮环节食品安全的直属机构。卫生局，是地方各级医院的主管部门。下设办公室、医政科、健教所、爱卫会等职能部门，分管食品卫生，执业医师法的实施，医疗事故的处理等等工作。
药监局的职能：
1、负责起草食品（含食品添加剂、保健食品，）安全、药品（含中药、民族药，）、医疗器械、化妆品监督管理的法律法规草案。
2、制定食品行政许可的实施办法并监督实施，组织制定、公布国家药典等药品和医疗器械标准、分类管理制度并监督实施，制定食品、药品、医疗器械、化妆品监督管理的稽查制度并组织实施，组织查处重大违法行为。
卫生局的职能：
1、贯彻执行国家卫生工作方针、政策和法律、法规；研究草拟和制定我市卫生工作的地方性管理办法；研究提出全市卫生事业发展规划和战略目标及卫生技术标准并监督实施。
2、制定社区卫生服务发展规划和服务标准，指导社区卫生规划的实施。
3、贯彻预防为主的方针，开展全民健康教育。组织指导全市急慢性病、传染病、地方病、职业病及重大疾病的综合防治。
4、制定全市农村卫生、妇幼卫生工作规划和政策实施，指导初级卫生保健规划和母婴保健专项技术的实施。
5、贯彻国家中医工作的方针政策，拟定全市中医药工作计划及发展规划，并组织实施，负责中医药行业管理，监督、指导中医医疗、科研、教学及中西医结合工作，负责处理中医医疗纠纷，审核中医广告。
6、依据卫生法规、标准，依法监督管理血站，保证采供血及临床用血质量。研究指导医疗机构改革，对全市医疗质量和服务规范实施监督。实行卫生专业技术人员执业注册和医疗机构从业许可证制度。
7、研究制定全市医学科技、教育发展规划，组织实施“科教兴医”战略，指导医学科技成果的普及应用工作。
8、制定卫生监督执法工作规划，并组织实施。
9、制定卫生人才发展规划和全市卫生专业技术人员职业道德规范，促进卫生行业的行风建设，协调有关部门搞好卫生专业技术人员职务的评聘工作。
2018年3月，根据第十三届全国人民代表大会第一次会议批准的国务院机构改革方案，将国家食品药品监督管理总局的职责整合，组建中华人民共和国国家市场监督管理总局；不再保留国家食品药品监督管理总局。
中华人民共和国卫生部曾经是中华人民共和国国务院主管卫生工作的组成部门，是中华人民共和国成立最早的政府部门之一。2013年十二届全国人大一次会议已通过国务院机构改革方案，卫生部与国家人口和计划生育委员会的计划生育管理和服务职能合并组建国家卫生和计划生育委员会。
参考资料来源：
百度百科-国家食品药品监督管理总局
百度百科-卫生局
药监局和卫生局是两个不同的独立单位。
卫生局主要是管理医院、卫生所、医生和公共卫生事业的单位。
药监局主要是管理药物市场的销售、查处假药等，互不影响。
卫生局是地方各级医院的主管部门。下设办公室、医政科、健教所、爱卫会等职能部门，分管食品卫生，执业医师法的实施，医疗事故的处理等等工作。
贯彻执行党和国家有关卫生工作的方针、政策和法律、法规、规章；结合本市实际，研究起草卫生工作的地方性法规、规章草案和政策；研究制订本市卫生事业发展改革的有关方案、工作规划、政策和指导性意见，并组织实施。
根据本市国民经济和社会发展总体规划，编制本市卫生事业的发展规划、区域卫生规划和年度工作计划，并负责组织实施。
两个不同的独立单位。 卫生局主要是管理医院，卫生所，医生，和公共卫生事业的单位 药监局主要是管理药物市场的销售，查处假药等 互不影响！
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