合作协议没有按手印 有法律效力吗

签字和盖章都具有法律效力。只要当事人签字，合作协议也同样具有法律效力。
　隐基　《合同法》第三十二条
当事人采用合同书形式订立合行携瞎同的，自双方当事人签字或者盖章时合同成立。
　　第三档空十五条当事人采用合同书形式订立合同的，双方当事人签字或者盖章的地点为合同成立的地点。

这实际上包含两个问题，分别作答吧：
一、关于你们两个之间的合作协议是否具有法律效力的问题。这个没有争议，是有效的，除非这个协议中还包括其他的、你所未述及的重要条款违背我国现行法律法规，否则合同的效力是无可置疑的。我国《合同法》32条规定：”当事人采用合同书形式订立合同的，自双方当事人签字或盖章时合同成立。“至于签了什么颜色的字，都不影响合同效力的。
二、关于目前问题的解决途径。这里面还牵扯几个小问题。一是在你们没有办理相关的经营权转移手续之前，这个店的经营权始终是在你手中的，这个有工商等管理部门颁发的证照，没有争议的；二是如果遇到重大的、不可抗的外部环境变化，导致合同不能继续履行，那么可以请求法院予以解除合同的。至于你所说的门面租约到期算不算这种不可抗力，就要看法院主审法官的认定了，一般而言是不会做这样的认定的。三是最好的解决方法，我个人认为是这样：尽快建立一个明晰的、规范的财务管理制度，并以补充合同的方式签订。比如，为了使双方顺利完成合作经营，对店面的财务管理作如下补充约定：店面现金由某某收取并保管、货物由某某管理清洞、账面由某某管理。每月（或者每季度甚至每天）什么时候由合伙人共同进行账目审核，要做到账实相符。如果发现账实不符，则由各自责任人自行负责补齐亏空。如果发现什么样的问题（比如账面亏空到一定程度，或者不能补足差额等等），则合伙协议取消，按照出资情况予以补偿。等等差不多这样内容的一些条款吧。这做困些规定不是什么过分的要求，你的合伙人应该没有理由拒绝签署。只要你的合伙人签了，答胡枯那么对他就有约束力，对你们以后的经营甚至是拆伙都了明确的依据。

双方的签字也有法律效力，司法鉴定过程中可以做笔迹鉴定。但是按手孙州戚印的效力更高些。如果试在谈不拢可以走法律途径，不能自己琢磨。提醒你再签类似协议迹搭得则陵作律师见证，你的麻烦就少多了。