生态农业注重环境的保护和建设，这既可以消除常规农业的一些负面影响，又可以克服有机农业的某些局限性。如果从可持续发展整体框架考虑，生态农业涵盖了有机农业，也可以认为，有机农业是生态农业的终极方式。
生态农业是生产过程中既要促进生态保护，又要依赖生态的有效支撑，针对的是农业生产体系；绿色农业主要讲防污染，也就是整个生产过程都是无污染、无公害的过程，针对的是农业生产经营方式；有机农业针对的是农业生产方式。
简而言之，有机农业是要求更为严格的生态农业，生态农业更加符合我国目前的国情，适合大力发展；而绿色农业是指生产、加工、销售符合标准的绿色食品（无公害、绿色、有机食品）的农业生产经营方式。
生态农业案例：青岛西麓生态农业公园规划
有机农业案例：辽宁大连有机休闲农场规划
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