一般是有的，但因为水稻食用部分为大米，可以免除直接被农药侵害，农药残留的量较小。因为大田环境下，水稻的病虫害相当多，虫害如稻飞虱，二化螟，三化螟，稻包虫，稻叶蝉，发生量大，种类多;病害如稻瘟病，纹枯病，稻曲病，稻粒黑粉病，也是相当多的。不可避免的要施用农药，一般是有机磷农药。但有些地方种植的早熟稻，可以避开病害虫的侵害，可制成真正的绿色大米。而且如果施用无公害农药的话，叶可以达到这个效果，但无公害农药目前推广的力度不够，使用面积不大。
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