女友说跟你有代沟的意思可能有以下几种：
1、你们在同一件事情上，对同一样东西的认识上不一样，因为每个人对同样的事情有不同的看法，所以当你和你的女朋友在同一件事情上有分歧的时候，她就会说你们之间有代沟来调侃你们思想上的差距，或者也是在表达她生气了的意思。
2、她可能在嫌弃你的年龄大，因为你们在年龄上有差距，所以会彼此不了解、不认同对方喜欢的东西，比如吃的、用的、生活习惯等等方面。
补充资料：
《十月》1981年第四期：“现在有一个新名词，叫做‘代沟’。据说是从日文转译过来的。意思是指两代人之间有一条鸿沟。”
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