海鲫鱼和鲫鱼主要区别是科目分类不同、形态特征不同、生活习性不同。
1、科目分类不同,海鲫鱼,俗名九九鱼、海鱮、福鲫、海刀子,属脊索动物门、鱼钢、海鲫科。鲫鱼,学名罗非鱼,别称南鲫、越南鱼、吴郭鱼、福寿鱼、金凤鱼,属脊索动物门、鱼钢、丽鱼科。
2、形态特征不同,海鲫鱼体被较小的薄圆鳞。背鳍鳍棘部有发达的鳞鞘,向后延伸至鳍条部,鳍棘折叠时可收藏于沟内。鲫鱼体侧高,背鳍具10余条鳍棘,尾鳍平截或圆,体侧及尾鳍上具多条纵,网列斑纹。
3、生活习性不同,海鲫鱼冷温性近海鱼类。鲫鱼原产非洲,属热带性鱼类,栖息在中下层,是以植物性饵料为主的杂食性鱼类。