在留资格证过期，自动失去了在留资格，即使持有有效的长期签证，也无法出入境。这种情况下，需要重新申请在留资格和签证，并在有效期内才能再次入境日本。
另外，海关对于出境的审查非常严格，如果发现你的在留资格已经过期，可能会拒绝你出境。因此，建议在签证有效期内尽快申请在留资格延期或重新申请，确保可以顺利出入境。
以上信息仅供参考，如有需要，建议咨询日本驻华大使馆或相关机构，以获取更准确和详细的信息。
在留资格认定证明书到期，自动失效，也就是失去了在留资格。
即便持有有效的依附于此在留资格的长期签证，同样是无法出入境的。
所以，签证下来后如果在留资格失效，需要重新申请在留资格和签证。
如有关于二者关系的疑问，请咨询驻华使领馆，而不是签证代办处。签证代办处不一定了解在留资格和日本出入境政策，可能会误导你。
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在留资格认定证明书上时间是唯一的依据。
而且，入管局也不允许入境。
如果不信，可以咨询日本驻华使领馆或者委托在日代理人咨询入管局。
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