您好，分公司的钱是要进入分公司的公账的，顾客开发票的抬头也一定要是分公司，顾客付的钱的话是要从顾客的公司名义上的公账打到分公司的公账上的，最后一个问题的话，是这样子的，每到年底都会有年底清算，到时候清算的时候汇总到总公司就可以了，希望我的建议有帮助到您~有什么问题可以关注深圳富信财务代理官网，我们在这里诚挚为您解答~
