1.特许经营协议中涉及或包括商标使用许可的，应按法律及行政法规规定，及时向国家工商行政管理局商标局备案，并报特许人和受许人所在地的工商行政管理机关备案;
2.许可人不得超过其
册商标的范围许可。《商标法》第二十条规定，注册商标的专用权以核准注册的商标和使用的商品为限;
3.不得滥施许可。我国商标法中对滥施许可行为及不顾商品质量的行为作出了责令限期改正，予以通报或罚款直至撤销其注册商标的处分规定;
4.加盟店要协助总店在当地登记商标或有关的知识产权人;
5.不能以加盟店的名义登记成为商标或有关知识产权的拥有者，除非获得总店的允许或指示;
6.确认商标及有关的知识产权的权益完全属于总店，如由于法律上或其它原因而使商标或有关的知识产权被认定为属于加盟店，则加盟店必须按总店指示办理手续将上述权益转让予总店;
7.若获悉任何第三者有侵犯商标或有关的知识产权的行为，应立刻通知总店，并按总店的指示及在总店愿意支付有关诉讼费用的前题下提出诉讼。
商业特许经营备案也不是所有企业都可以进行申请的
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