php.ini的部分参数可以在php程序里设置，ngxin和apache的配置文件可以在vhost里配置引用不同的外部配置文件，iis不是很了解，估计不可以单独使用不同的ini文件，你又什么需求呢？说出来大家可能有别的思路解决你的问题
