根据有关规定：
毕业时落实就业单位的毕业生，学校根据就业协议书核发就业报到证；
未落实就业单位的，可以继续择业，择业期为二年。
择业期内可以办理首次领取报到证和改派、补发报到证手续。
择业期结束时未落实就业单位的，学校按规定将报到证开回到毕业生家庭所在地人事部门。
你07年毕业，09年就已经择业期满了，因为学校扣留毕业证的行为已经违法，所以，你首先应该回学校问一下相关情况，协商处理；也可以向法院起诉，要求赔偿因此造成的损失。
由于你上个月才拿钱去取了毕业证书和档案，你的工龄很难被承认，也没有转正定级表，参加公务员考试资格都成问题！你的档案是未就业状态（学籍档案而已），只有放到人才中心后才能转变为人事档案的，而这需要报到证或办理档案托管手续。
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