稻田杂草出土深度与杂草种类及土壤质地有关，即取决于这类杂草的休眠特性、萌发条件、种子大小、子叶形态等以及土壤硬度、保水能力等因素。一般说，小粒种子、光解除休眠的双子叶杂草以及一年生莎草科杂草，如异型莎草、碎米莎草、节节菜、陌上菜、水苋等发生在浅土层；稗草籽粒较大，子叶不出土，休眠解除对光不敏感，出土较深，但对氧分压需求较高，出土深度也受到限制。据试验（以定量种子置于不同土层）资料，无芒稗种子在浅土层（1～2厘米），出苗率为74%，土层5厘米，出苗率为66%，10厘米，出苗率为25%，20厘米以下不出苗。
多年生杂草地下根茎体积较大，养分充足，具有较强的顶端优势，出苗深度较深、特别是野荸荠等可在20厘米以下土层中萌发。
由于土壤的质地不同特别是含水量不同，土层中氧分压也不同，也影响杂草的出土深度。如稗草，在湿润条件下出土深度约8厘米，饱和水状态出土深度为4厘米，淹水状态下则仅2厘米。水莎草的地下块茎在土壤含水量20%～40%时出土深度可达10～15厘米，饱和水及淹水状态下不能萌发。
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