星际争霸Ⅱ的场景地图

游戏除了沿用第一代作品的地图总体设定，还成功加入了3D游戏的Z轴，实现了真正的立体画面。
游戏地图只有地面和空中的区别，地面有高地与洼地的区别，在低处的单位在遭到攻击之前无法看到高处；而按照剧情，地图的不同环境绝大多数仅仅体现在外观。空中单位可以穿越一切障碍并且视野不受地形限制。
在剧情战役模式下，有时会出现封闭环境的地图，此类地图中没有矿物，并且不会出现空中单位。
游戏提供了地图编辑器，允许玩家修改或制作不同的对战地图。
星际争霸2的游戏本身虽然没有给单位开放道具栏，但是其丰富的地图引擎可以像《魔兽争霸3》一样开放道具栏编码，从而制作大量风格迥异的自定义地图。 在游戏的战役模式下，玩家可以进入相应的大本营。不论《自由之翼》、《虫群之心》还是《虚空之遗》，游戏都在战役章节之间设置了类似主营、旗舰的场景，随着剧情发展有时会有相应的变更，例如人类的休伯利安号，异虫的利维坦，星灵的亚顿之矛等等。
在大本营里，玩家除了可以和重要NPC对话，还可以选择升级科技、调整下一战役部队的部署等等，这些活动都在不同的场所，玩家可以在这些场所中自由切换。　　
大本营的场景是动态的，随着剧情的交代，相应的单位或者设施会逐渐出现在场景中。