可以去医院说明情况，把存根联复印，但必须有住院的医院重新盖章，且出示证明为原来存根的复印件及只供报销使用不能重复报销。 都是这样操作的，如果不给你办 你可以找他领导投诉。
我的合作医疗和医院发票，户口本，身份证全丢了，怎么办，合疗给报销吗
