这个问题应该分析一下在土地管理所交的是什么费用：1、如果交的是批准建房一类的费用，说明土地管理所已经认可在这片土地上建房，房子建好以后，应该凭收费收据到土地管理所办理产权证。这个房子不能说是违章建筑；2、如果交的是罚款一类的费用，则说明土地管理所不认可在这片土地上盖房的行为，收费是一种处罚的性质，那么这样建起来的房子就是违章建筑。
