宅基地上房屋倒塌的宅基地使用权不能确权。
宅基地与房屋的所有权是有区分的，宅基地是属于农村集体组织所有，而宅基地上的房屋却是属于农民，如果宅基地上房屋出现了倒塌，那么房屋就丧失了其应该有的属性，宅基地也将会被农村集体组织收回。
国土资源部《确定土地所有权和使用权的若干规定》中第五十二条明确规定：空闲或房屋倒塌、拆除两年以上未恢复使用的宅基地，不能确定使用权，对于已经确权的宅基地，经过县级人民政府批准之后，将会注销土地登记，宅基地由农村集体组织收回。
如果农村的房屋倒塌时间在一年之内，农民则需要在宅基地上重新修建房屋之后，才能够进行确权工作，但现在许多农民都存在着一户多宅等相关问题，这一类农民多余的宅基地倒塌之后，则直接会被收回其宅基地使用权。
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