玛曲县隶属甘肃甘南藏族自治州,位于甘肃省甘南藏族自治州西南部,青藏高原东端,甘、青、川三省交界处,黄河第一弯曲部。地处东经100°45′45″~102°29′00″,北纬33°06′30″~34°30′15″之间,东北以西倾山为界与本州碌曲县接壤,东南与四川省阿坝藏族羌族自治州的若尔盖县、阿坝县为邻。
玛曲县总面积是10190平方公里, 境内海拔在3500~3800米之间,平均 海拔是3700米。
玛曲县海拔最高的地方在欧拉乡乔木格日峰海拔为4806米
玛曲是甘南州的一个县,在甘南州西南角,是甘青川三省交界,距州府合作市200公里,合作距离省会兰州200公里。