可能的两个原因：
你目前的开发工具（IAR或keil）对低版本的工程不兼容导致，尤其是使用低版本软件打开高版本工程，很容易出现这个问题（PS：前几天我使用IAR就遇到这问题，在设置上下功夫没有任何作用），解决方法：使用你现在的开发工具新建工程，重新添加源代码（这个过程不熟悉的话请自行百度）
你的程序烧写最终的起始地址不对，STM32内部flash是从0x08000000这个地址开始执行的，若你的代码起始地址不是这个，就很容易出现问题。（起始这条可能不适用你的情况，这种情况的结果是仿真可以进入主函数的，但独立运行就不行了）。
在main里加个断点，全速运行可以试试
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