博物馆岛有五个博物馆，岛的最南端，紧邻宫殿大桥和柏林大教堂的是老博物馆(AltesMuseum)，在它前面伸展着卢斯特花园。最北端是新博物馆(NeuesMuseum)和老国家艺术画廊(AlteNationalgalerie)。面向西侧的是佩加蒙博物馆(PergamonMuseum)，最外侧的是博德博物馆(BodeMuseum)。
老博物馆建于1830年，由申克尔(Schinkel)设计。它是普鲁士第一座公众博物馆。博物馆周围耸立着古老教堂建筑。踏入馆内，各种古罗马立像装饰圆形殿堂，显得庄严肃穆。数十尊运自青州博物馆的佛教造像，被布置在黄色墙壁烘托出的佛教氛围之中，焕发出令人惊奇的光芒。
新博物馆建于1843年至1859年，由施丢勒（F.A.Stueler）设计。新博物馆是为分担老博物馆的藏品太多的压力而建，整个建筑依展览内容，同历史发展的各阶段相呼应。二次大战中的轰炸使新博物馆成为一片废墟，新馆建筑由建筑家大卫·切波菲尔德（DavidChipperfield）设计，预计到2007年完成。
国家艺术画廊，现称老国家艺术画廊，建于1867年至1876年，同样由施丢勒设计。最初意在建造一个“科学家的殿堂”，建成之后却成为德国十九世纪绘画的收藏馆。建筑外层带有高大、宽阔的阶梯，和弗里德里希·威廉四世骑马铜像。整个建筑于五十年代被重新修建。自1997年起再次得到重修。
建于十九世纪末二十世纪初的博德博物馆是带有巴洛克风格的建筑。建筑强悍的圆顶和宏伟的入口大厅宛如横跨在施普雷河上的一条大船。当时的博物馆大臣威廉·冯·博德将内部的展厅按照各各时代的风格逐一进行设计。该馆的修复工程于2005年已全部完成。
佩加蒙博物馆是岛上最年青的建筑，建于1930年。它共分为三个主题馆：一是古典希腊罗马时期收藏馆、另一是近东古文物以及伊斯兰艺术馆。
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