为什么C语言编译器编出的软件，只能在windows下运行？？

没有这回事。
首先，C语言是编译型语言。同样的代码，使用windows下的编译器产生的可执行文件就只能在windows下运行，但是用linux下的编译器编译出来的可执行文件就可以在linux下面运行。因此跟你所处的环境有关，而跟C语言编译器本质上并没有太大的区别。
举个例子，比如gcc编译器，有windows版本，也有linux版本，用不同的版本编译，就能运行于不同的环境。

然后说一下解释性语言，比如java，所有的java代码都运行于虚拟机jvm上，是靠jvm来解释执行，jvm在这里也就充当了上面编译器的角色(只能说类似)。所有java代码可以直接跨平台执行，因为不同版本的jvm已经有人为我们做好了。

你的代码如果移植性好的话，一段代码，在windows下编译后，在windows下运行；拿到linux下，重新编译，就可以在linux下运行，不是说你C语言编译器编出的可执行文件。而是不同平台的编译器。

其实我一也不是很专业，在这里发言有mark的意思，等看高人答案。

我理解的是这个就好像是人类和大猩猩一样，同样的挥手，对人来说是友好，但是对大猩猩是骂人（笑话里的）。
不同的系统，对程序代码的解释是不同的，所以会出错吧。
就好像.net程序在没有.net framework库的时候就是在windows下也是打不开的。

等高人。