西汉初至公元2年间,建县,名余暨,属会稽郡。孙权黄武年间(公元222-229年),改名永兴,属会稽郡。唐天宝元年(公元742年),改为萧山,以萧山为名至今。1949年5月5日,萧山解放,为省直属县。1949年6月,划归绍兴专区。1952年,复为省直属县。1957年划归宁波专区。1959年改属杭州市。1987年11月27日,国务院批准,撤县,设市(县级)。1988年1月1日,萧山县改称萧山市,仍属杭州市。2001年3月25日,萧山举行撤市设区挂牌,杭州市萧山区宣告成立。
萧山区是杭州市下辖的一个区。