A、辐射能导致基因突变，而基因突变是不定向的，A正确；B、血红中一个碱基对的改变导致基因突变，但由于密码子的简并性等原因，基因突变不一定会导致血红蛋白合成异常，B错误；C、不同染色体之间的片段交换一定造成染色体结构变异，也可能是会造成基因重组，C错误；D、如果果蝇的长翅基因缺失，则说明其发生了染色体结构变异（缺失），D错误．故选：A．
