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我现在有两段引物序列，如何通过BLAST来查到这对引物能扩增出的基因片段序列

2025-01-06 05:33:10

推荐回答（3个）

回答1：

引物大吗？
如果二十几个bp以上的话，能查出来
正向引物不变，反向引物找反向互补序列，(就是说AATCGGATCCTCj就要翻成GAGGATCCGATT)把这两个序列用两个空格分开，或者用逗号隔开去blast，为了精确，应该在高级选项限制条件里选择你要的那种生物，你要的那种基因（比如是酶就选择酶那一类）。
然后在结果里认真找哈~~

回答2：

在以下网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome
Primer Parameterse下输入你的上下游引物序列
Primer Pair Specificity Checking Parameters下的Organism中输入你扩增的物种
再点击页面坐下方的“Get Primers”即可查看到扩增出的基因片段

回答3：

分别将正向引物直接放上去，反向的要反向互补下在放上去，分别blast出的全互补的基因看看。记下基因名和位置，有的这样能查出来。