同源基因间的组合，又叫做基因重组。
细胞要进行基因重组，必须有一套机制。其中一条就是重组基因的两端必须有序列相同的DNA判断，这样进行重组的酶才可以切割并且再连接。
非等位基因之间有两端序列相同的情况就非常罕见了，所以一般没有非等位基因之间的组合
非等位基因：位于同源染色体的不同位置上或非同源染色体上的基因
你的问题是非同源染色体上的非等位基因自由组合吧？同源染色体在有自由组合的时候是要在形成配子的时候，但是这个时候同源染色体是要分离的，那么就谈不上在同源染色体上的非等位基因的自由组合了，就好像你和一个人分别坐着汽车。一个上北京，一个下广州，那就谈不上还能坐在同一辆车上了。
在减数分裂的时候，有一个机会是四分体的联会时期，这个时候同源染色体会交换一些等位基因，但是这个不是自由组合，就像不论你愿不愿意，你坐的车都会开进加油站加油一样。
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