制药工程的专业更多的是面向药厂类的，而中药学的话是医院多一些。我是学药学的，药学专业就业面呢，更广一些。我没有听过制药工程的执业药师，应该是只有执业药师证这个大类，在全国统一的执业药师的考试中通过后，领取《执业药师证》，然后在生产、流通、使用的单位任职后才能在省药物监督局注册。
制药工程可以考中药师，中药学同样可以考执业药师。两个专业都差不多，看个人兴趣了。
执业药师只分中药和西药，没有什么制药工程的。如果按挂靠，那么中药的值钱些。
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