PCR时loading buffer的位置就代表DNA 的位置吗？一般loading buffer到什么位置时可以终止电泳？

不代表
前面的蓝色的条带是溴酚蓝，代表的片段大小是 300bp，后面的有点绿色的条带是二甲苯青，代表的片段大小在4000bp左右。
loading buffer的功能主要有两个。第一，里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯酚起到指示的作用，显示电泳的进程，以便我们适时终止电泳；第二，里边的成分甘油可以加大样品密度，使样品密度大于TAE，从而沉降到点样孔中，防止样品飘出点样孔。
只是用于指示作用，防止跑胶跑过了。一般跑电泳时，片段的大小很少小于300bp，大于4000bp，目的DNA片段的电泳迁移率介于两者之间，当前面的蓝色条带迁移到4/5的位置时就可以终止电泳了，蓝色条带在胶内，那么扩增的DNA片段一定还在胶内，其位置在蓝色条带的后面。

loading buffer的功能主要有两个。第一，里边的指示剂溴酚蓝和二甲苯酚起到指示的作用，显示电泳的进程，以便我们适时终止电泳；第二，里边的成分甘油可以加大样品密度，使样品密度大于TAE，从而沉降到点样孔中，防止样品飘出点样孔。
这样就是说loading buffer与DNA结合，所以loading buffer所在的位置就是DNA的位置。
电泳结束，一般要看DNA片段的大小。比如说我们实验室用的Maker是1000bp，我们一般都是等蓝色条带跑到第四格时就停止电泳，一般是20分钟左右。

不代表，loading buffer中的溴酚蓝条带一般指示了300~400bp长度的条带的位置，二甲苯青代表的是4kb（具体我忘了）的条带。