如果南京这家公司没有破产/倒闭/关门等情况，那么还是需要它开的离职证明的，“南京公司解释说因公司搬家，人员变动，再加上已经超过2年，过了办理期限，不予办理。”这些都是托词，建议你找人疏通一下，只要你真实在这家公司做过，我相信写份离职证明没什么大不了的。反过来说如果这家公司倒闭关门了，那可以到其原所在地工商局档案管理处调个停止营业什么的证明就可以了（得给工商局交个调档费）。
一个办法还是去找哪家公司，因为你跟他们签过劳动协议，他们又义务帮你证明。
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