关于《最高人民法院关于办理减刑、假释案件具体应用法律若干问题的规定》的案例与疑问，望解答？

让我考虑一下，再来回答。现在有点累，但总的来说不要太乐观，因为说实话，监狱能帮忙的话是不会刁难你们的。我会尽量从你们的角度加以考虑。
2001年12月7日两高《关于适用刑事司法解释时间效力问题的规定》
第三条意见：对于新的司法解释实施前发生的行为，行为时已有相关司法解释，依照行为时的司法解释办理，但适用新的司法解释对被告人的，适用新的司法解释。
尽管上述规定针对的是被告人，不是受刑人，但它的原则精神在本案中有适用的余地。另外刑法的时间效力中著名的从旧兼从轻的原则也完全值得借鉴。刑法第十二条参照（有点啰嗦）中华人民共和国成立以后本法施行以前的行为，如果当时的法律不认为是犯罪的，适用当时的法律；如果当时的法律认为是犯罪的，依照本法总则第四章第八节的规定应当追诉的，按照当时的法律追究刑事责任，但是如果本法不认为是犯罪或者处刑较轻的，适用本法。本法施行以前，依照当时的法律已经作出的生效判决，继续有效。
从根本上说这个案子是法律（当然也包括司法解释）的溯及力的问题。这里引用一下台湾学者史尚宽的话：“要以法律之溯及力如何，本无一定原则。当探究各条之性质如何，而为个别之规定，为最得策也。”所以这个案子有搞头，要精通法律，又要与监狱、中院或高院关系良好的律师帮忙才行。花个三五千块钱请个律师出面吧，记得事成之后才付大部分款项，免得囿于情面不去力争，反而说服你们服判息讼之类的。如果还有困难，也可以再来提问，我愿助一臂之力。
至于您所说的程序，我觉得可以向监狱所属的监狱管理局反映，再由他们与中院或是高院协调。