这部剧场版是把漫画版的数码暴龙编年史缩小编制而成的，编年史里面有人类，主角搭档是多路兽和龙珆兽（究极体是阿尔法那把剑），战暴X和钢加X就等于第一部的狮子兽一样为了守护数码精灵而存在，对谁他都要保护的，因为死了就要去数据空间，去到那里就会有机会感染X抗体（几率很低），然后复活，红莲被插死后不是就变成红莲X回来了吗。加楼达兽被奥米加干掉了，其他数码兽挨奥米加那剑之后拦腰切断，背景是世界树觉得数码宝贝数量太多，启动X程序杀掉绝大部分的数码宝贝，但有部分特殊个体死后到了数据空间感染了X抗体又复活了不但没事还能力大增，世界树就派奥米加把那些没死的全部干掉，主角多路兽是一只天生带有X抗体的数码宝贝，他是世界树的实验品，为了逃避其他数码宝贝抢夺他的X抗体的追杀而逃命
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