好问题。本来以前写的教程里有这段，教程丢了，那我就借机重写一次好了。
先说结论：能写成汉字的名词都写成汉字，动词和形容词的词干都写成汉字，代词可写可不写，表示语法意义的东西都不写成汉字。
然后我们来看个例句：バスが徐に来ています。
我们知道日语书写有四种元素：汉字，平假名，片假名和罗马字。
罗马字相当于日语的拉丁化转写，平时不怎么用，论外。平假名和片假名相当于拼音。所以按照中文的逻辑上面那句话就像是：
Bus 慢慢de zhengzai 来（巴士正在慢慢地来）
这句话中的拼音部分de对应「徐に」的「に」，是副词或者说状语的标志，「ています」虽然可以写成汉字「て居ます」，但在这里属于补助动词，以表示动作正在进行，仍是语法的概念，所以写成假名。
バス是外来语，本来是BUS，所以写成了片假名。
这句话里唯一的两个汉字「徐」是形容动词「徐な」的词干，表示缓缓地，徐徐地，本身就来自汉语，因此写成汉字，「来」是动词「来る」的词干，是把日语的概念用汉字来书写出来，所以也写成了汉字。
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