A、洋葱鳞片叶表皮细胞的显微照片属于实物，不属于物理模型，A错误；
B、成熟植物细胞具有大的液泡，细胞核不位于细胞的正中央，B错误；
C、染色质是极细的丝状物，存在于细胞分裂间期，在细胞分裂期，染色质高度螺旋化，呈圆柱状或杆状，这时叫染色体．染色质和染色体是同一物质在不同时期的两种存在，C正确；
D、酶的化学本质是蛋白质和RNA，蛋白质合成的场所是核糖体，而RNA的合成场所是细胞核，另外分泌到细胞外的酶合成直接相关的细胞器是核糖体、内质网和高尔基体，线粒体只是提供能量，D错误．
故选：C．
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