这就是这部作品高深之处了，在哪里之后真嗣已经崩溃了（里面又讲到驾驶员心理图），飞到天上是完成补完计划，量产机、初号机和郎枪的生命之树图形是完成补完的仪式。莉莉斯把全人类变成了LCL之水，然后以初号机为中心完成补完，这之前都是SEELE的计划，但是在凌波丽的引导下碇真嗣拒绝了补完（后面有画面转到他和大家在一起的那一幕），黑之月破裂，补完失败。
补完结束后莉莉斯失去了AT力场维持身体而破碎了。
但是初号机中的啶唯说，只要人有活下去的信念，就能恢复原来的样子。也就是说，人类需要靠自己完成补完。比如明日香。
真嗣掐明日香是因为痛恨自己，就像之前掐住明日香一样。明日香对拒绝了自己和所有人的真嗣感到恶心，所有才有最后那句话。
悲剧结尾才是王道
我离开的时候请照顾好大家
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