这个就要看你们领导说的意思了，理解有好多种。
你们这笔主营业务收入有结转成本吗？
如果这笔款与老板结算时，是直接从应付老板的款项中扣除？还是说这笔款项根本就不收了，当时送个老板了？
如果你们没有成本，领导说不用收，那就直接当这个事情没发生。
如果你们有成本，是扣除应付老板款项，那就把老板应付与这笔应收对冲，如果是送老板了，就看情况进损益吧。
个人觉得你们领导的意思是不做账务处理的意思。
发生一笔款项5000元，发生时分录为，
借：应收帐款 5000
贷：主营业务收入 5000
这笔应收款领导说不用收，在与老板算帐时扣出。可以把应收账款，转成其他应收款：
借：其他应收款-老板 5000
贷：应收账款 5000
供参考。
那就是和老板结算
借：其他应收（或付）款-老板5000
贷：应收账款-xx公司5000
看扣除时冲抵的哪一项，根据实际情况：
借：收入、费用、往来等
贷：应收账款
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