轨道舱会继续在轨运行，以前的神舟飞船的轨道舱都会继续在轨运行超过半年的时间，直到轨道高度不断降低，最终再入大气层烧毁。天宫一号的设计寿命是两年，等天宫一号达到设计寿命，推进剂消耗完之后，也会同样再入大气层烧毁的。天宫二号作为天宫一号的备份已经制造出来了，等天宫一号寿命一到就会继续发射天宫二号来接替天宫一号的工作。
