但是，根据经典的电磁理论，带正电的核与带负电的电子的静电引力使电子产生了一个向心加速度，使电子绕核运动。而电子在获得加速度的情况下必定发出电磁辐射，这电磁辐射就要消耗能量，能量不断消耗的结果，将使电子的运动轨道越来越小，最后必然落到核上与核合为一体。此时，这个原子就要消失。这就是说，卢瑟福的模型不能保持一个稳定的原子结构系统。而事实上原子是十分稳定的。因此，他的模型还有缺陷。
