应该说两个叫法本质是一样的，区别在于：水利水电建筑工程是普通高校本科专业目录第二次修订版（1993颁布）的叫法，专业代码为080902；而水利水电工程是第三次修订版（1998颁布）的叫法，专业代码080801。所以，现在应该叫水利水电工程，而不应再叫水利水电建筑工。当然，高等专科院校也有水利水电建筑工程专业。个人理解，供你参考。
前面“我爱高原雪”的回答很准确。
