按照常规，五险一金跟户口档案是没有关系的。
1、五险一金的账号就是你的身份证号，只要有身份证复印件，单位就可以为你办理五险一金。
2、正规的单位不会因为你是外地户口，而不给你交五险一金，不过有一些小单位、抠门的单位确实以外地户口为借口而不给交公积金的
3、五险一金的缴费方式分足额缴费和基本缴费2种，即按全额工资缴费，和南京的最低基本工资缴费
4、你的五险一金的使用：其中医疗保险只能在南京市区使用，只要每月缴费，就可以一直使用。公积金可以在南京购买房产时使用，养老保险吗，就有点遥远了，退休以后，拿着银行的本子，回老家也能领退休金
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