微生物生态学是研究微生物与生物、非生物环境之间相互作用的现象、过程和机理。主要研究内容有:
1 研究微生物生态学所用的传统和现代分子生物学方法;
2 在正常自然环境中的微生物种类、分布及其随着不同的环境条件变化而发生的变化规律;
3 在极端自然环境中的微生物种类和它们所起的作用,在极端环境中微生物的生命机理;
4 在自然界中微生物之间的相互关系,微生物与动植物之间的相互关系,这些相互关系对自然界的影响和环境因素对这些相互关系的影响;
5 在正常自然环境中,微生物代谢活动对自然界的影响,环境条件的变化对这些代谢活动的影响;
6 污染环境中的微生物学;
7 微生物产生的生态友好物质;
8 微生物的生态模型。