1、3%的增值税是不能抵扣的，不能填列在增值税纳税申报附表二中。只有17%的增值税和运费发票才能抵扣进项税。2、需要缴纳其他附加税。城建税税率要根据当地实行情况（7%或5%)，教育费附加和地方教育费一样。3、应该由甲方去当地税务局代开，但不能抵扣。
代扣代缴3%的不是增值税，而是营业税。凭税务局税票回去可以抵账，不用再交流转税和附加了。
