如果论专业的话，当然还是交大好
1.虽然同为华东五校，但是上海交大的地理位置远比中科大优越。如果你以后想留上海找工作的话不要犹豫就选交大吧~
2.交大计算机系有计算机理论重点学科，中科大计算机系无。交大计算机系今年复试线347，科大335（计算机系专业课全国统考，所以具有可比性）
3.这几年的发展势头交大可谓迅猛，各项投资扶持都很大，比起中科大来说远拥有更好的前景
总体说来，交大高考难度仅次于清华、北大。研究生录取难度仅次于清华（你可以从高考分数线和研究生复试线来看），所以说如果想上交大还是需要努力的。科大也是非常不错的学校，不过至少在计算机上，相对于交大还是弱一点，不过也相对好考。所以最后的决定还是取决于你，祝你好运！
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