不含酒精的消毒洗手液可能含有双氧水（H2O2）或次氯酸钠(NaClO)或臭氧(O3)等，双氧水或次氯酸钠或臭氧都有强氧化性，能使细菌中的蛋白质变性从而起到杀菌消毒的作用。
不含酒精的消毒洗手液中可能含有含氯的杀菌剂，可以使细菌中的蛋白质变性从而起到杀菌作用
不含酒精的消毒洗手液中也可能含有表面活性剂，在医药行业中可作为杀菌剂和消毒剂使用，其杀菌和消毒作用归结于它们与细菌生物膜蛋白质的强烈相互作用使之变性或失去功能，这些消毒剂在水中都有比较大的溶解度，根据使用浓度，可用于手术前皮肤消毒、伤口或粘膜消毒、器械消毒和环境消毒；
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