1、所有款项都在往来科目,首先确定是否属往来款,是否属投资,是否涉及股权变更。你说的不够详细不好判断。2、“B把在C公司的股权转让给了D公司”涉及股权变更,即资产重组。作为对价支付的是股权、资产、现金?按你所说的是不是以现金支付的,是否产生溢价。根据不同条件,会产生一般性税务处理和特殊性税务处理。3、因为你说的不够清晰,具体你产考一下财税[2009]59号文件吧。