都是一样的，只是存档地方不一样，你考入公务员以后只要有能够调档的单位就都是一样的。
这两处存档不同的是社会保险这些，存放在当地，你需要自己缴纳社会保险跟存档费，存放在公司应该是公司统一交。从保险这块来讲存放在公司会好一些，尤其你要是没有考上公务员，社会保险的缴纳时间将跟你以后退休费挂钩，需要保证一定时间的连续缴费记录。当然你也可以自己交够年限，不过你们公司比较正规，应该在工资里面都代扣社保费用了，这样相当于交2次钱，并且公司这部分没有进入你的社保账户。
真说要担心的话就是存放在单位的话，如果真的考上公务员，有没有可能存在不放人，不调档的情况。
不用听公司的呢不用转，私企没权利保存档案的。如果你老家的人才给你转正了你的工龄已经开始计算了。
转过去也没事，大不了到时考上公务员在转回来，现在公司要档案可能涉及到工龄什么的，应该是有用的
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